Em meados de 1549, seis jesuítas da companhia de Jesus acompanharam o governador geral, Tomé de Souza, estes eram chefiados pelo padre Manoel de Nóbrega, em 1580, que sustentava e muito o cristianismo no Brasil.
O cristianismo chegou ao Brasil no descobrimento, onde foi realizada a primeira missa no Brasil e lançou profundas raízes da sociedade, durante o século XVI e XVII, o governo português representados pelos governadores-gerais buscaram o equilíbrio entre o grande governo central e a igreja católica.
Desde então alem dos grandes conflitos a igreja católica é predominada no Brasil desde essas épocas.